基本機能詳細

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ライフサイエンスソリューション

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DNA配列データのアセンブル
DNAシーケンサーから出力されたシーケンスデータを独自のアルゴリズムを用いてアセンブルします。相補鎖に対するアセンブルも行います。（右図中のオレンジ色の矢印は、相補鎖がアセンブルされているシーケンスです。）
DNA配列データのアセンブル　画面サンプル

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波形データの表示と編集
波形データを読み込みグラフィックで表示します。
表示を見ながら、ベースコールの変更（編集）が可能です。
波形データの高さを調節できます。
塩基（ACGT）毎に表示、非表示を指定できます。
セカンドピークの検出が可能です。
波形データの表示と編集　画面サンプル

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様々なDNA解析
スタートコドン、ストップコドンの探索
制限酵素サイトの探索と表示
アミノ酸への翻訳
モチーフ検索
（右の図は、制限酵素サイトの探索結果の表示です。）
様々なDNA解析　画面サンプル

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クオリティデータの表示
シーケンスのクオリティデータを含んだファイルを読み込みトリミングなどに利用することができます。また、クオリティデータをもったデータを読み込むとビューアでカラー表示することができます。
右図、デフォルトでは、クオリティーが低い部分が濃い色で表示されます。
クオリティデータの表示　画面サンプル

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シーケンスデータのトリミング
ベクター配列や低クオリティー配列のトリミングを簡単な操作で行えます。
データの保存
コンティグとそれを構成するフラグメントをSEQUENCHER独自の形式で１つのファイルに保存できます。
エクスポート
アセンブル結果のサマリーだけでなく、コンティグの連結状態をテキストでエクスポートできます。
印刷
アセンブル結果のサマリーやビューの他、波形データなどを印刷可能です。
塩基配列の検索
配列データ中の特定の塩基配列の検索において、連続検索や逆方向の検索ができます。
音声による読み上げ機能
塩基配列を音声で読み上げる機能を搭載しています。

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