トランスクリプトーム解析

概要

mRNA塩基配列解析に基づく遺伝子発現解析を行います。 リードを、ゲノム参照配列に対してマッピングし、遺伝子毎の発現値を算出します。 新規転写産物や新規スプライシングバリアントの探索にも威力を発揮します。

解析の流れ

• 指定参照配列へのマッピング
• 遺伝子の発現値を計算し、アノテーションを付加
• 新規の遺伝子発現領域候補を計算
• サンプル間で発現値が変動した遺伝子を計算

参考価格・参考納期^*1

（解析例）Illumina社 Genome Analyzer (GA-II) 2サンプル分(コントロール/サンプル)塩基配列 （各サンプル１レーン：約800万リード）を受領し、参照配列へマッピング後、遺伝子発現値を算出し、 サンプル間で発現値が変動した遺伝子の一覧をお納めします。

*1 実際の費用・納期に関しましては、お客様のご要望をお聞きし、お見積りさせて頂きます。

解析事例

• トランスクリプトーム解析によるマーカー探索
  • Roche社454シーケンサーを用いることで、網羅的なEST（Expressed SequenceTag）解析にかかるコストが、従来法に比べ大幅に削減できます。ゲノム配列が解読されていない生物についても、トランスクリプトーム解析からSSR（Simple Sequence Repeat）やSNP（Single Nucleotide Polymorphism）の候補を探索することができます。

■ お問い合わせ先 株式会社日立ソリューションズ　@Sales24