基準株(Type Strain)データベース構築システム

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基準株(Type Strain)データベース構築システム

基準株(Type Strain)データベース構築システムでは、時間と手間のかかる基準株データベース作成を自動化することができます。

お客様独自の抽出条件・キーワードで公共データベースから基準株データを抽出し、お客様のご要望に沿ったデータベースを構築します。

課題

  • 塩基配列に関する基準株(Type Strain)データベースを必要としているが、高品質なデータベースが存在しない。
  • 自力で公共データベースから基準株データを抽出して構築するのは非効率である。

メリット

  • 公共データベースからの基準株データ抽出を自動化し、データベース構築にかかる労力を低減します。
  • お客様独自の抽出条件/キーワードで基準株データを抽出できます。

解決イメージ

基準株データ抽出条件を複数指定し、マッチする配列データのみを公共データベースから抽出します。

抽出条件には、キーワード・配列長・相同性などを指定できます。

カスタマイズにより、公共の基準株データベースから基準株IDを取得し、キーワードとして利用できます。

構成例

構成例の概算費用

基本構成*1*2:2,000,000円~(消費税別)

基準株DB対応カスタマイズ(1サイト)*1*2:500,000円~(消費税別)

*1 ハードウェア費用、OSを含むミドルウェアの導入・設定費用、保守費用は含まれていません。機器導入やクラウド環境の構築に関してもご相談を承ります。
*2 カスタマイズ費用は抽出条件の項目数により変わります。上記は項目数5とした場合の概算費用です。

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